staple(ST turn，ST motif 和 ST staple)

ST转位是蛋白质和多肽的一个结构特征。每个残基由三个氨基酸残基(标记为i, i+1和i+2)组成，残基i是丝氨酸(S)或苏氨酸(T)，从侧链氧基到主链残基i+2的NH基形成氢键。

ST转位，一个带有N端丝氨酸的三氨基酸残基基序。丝氨酸侧链和前面两个残基主链之间的氢键用灰色虚线表示。碳是灰色的，氧是红色的，氮是蓝色的。第二和第三残基的侧链被省略了，第三残基的主链CO和所有的氢也被省略了。

类似的基序发生在作为残基i的天门冬氨酸或天冬酰胺上，称为asx转位。asx转位和ST转位可以区分为四种类型:I型、I '型、II型和II '型。这些类型(通过侧链-主链模拟残基i)与更丰富的氢键β转位相对应，β转位有四个残基，残基i的CO和残基i+3的NH之间有一个氢键。关于它们在蛋白质中的出现情况，它们的不同之处在于I型是四种β转角中最常见的，而II '型是ST和asx转位中最常见的。

Asx和ST都经常出现在α-螺旋的N端，作为Asx基序或ST基序的一部分，而asx、丝氨酸或苏氨酸是N cap残基。因此，它们通常被认为具有螺旋盖特征。

在T细胞受体的CDR3区域(B链，V结构域)提供了ST转位功能相关的证据。

一部分ST转位伴随有一个主链-主链氢键，这使它们有资格成为ST基序。

ST基序是蛋白质和多肽中普遍存在的特征。它由4或5个氨基酸残基组成，其中丝氨酸或苏氨酸是第一个残基(残基i)。它由两个内部氢键定义。一个位于残基i侧链氧与残基i+ 2或i + 3主链NH之间;另一个是在残基i主链氧与残基i+ 3或i + 4主链NH之间。有两个网站可用于寻找和检查蛋白质中的ST基序:Motivated proteins和PDBeMotif。

ST 基序，一种具有N端丝氨酸的五肽，与后续残基的主链原子形成两个氢键碳是灰色的，氧是红色的，氮是蓝色的。氢原子省略了。主链-主链氢键为红色，侧链-主链氢键(也形成ST转位)为灰色虚线。

当其中一个氢键位于残基i的主链氧和残基i + 3的侧链NH之间时，基序包含一个β转位。当其中一个氢键位于残基i的侧链氧和残基i + 2的主链NH之间时，基序包含一个ST转位。

与ST转位一样，很大一部分ST基序出现在α螺旋的N端，丝氨酸或苏氨酸作为N cap残基。因此，它们通常被描述为具有螺旋盖特征。

一个相关的基序是asx基序，它有天门冬氨酸或天冬酰胺作为第一个残基。在α-螺旋n端，两个保守的苏氨酸作为ST基序出现，形成了SF1和SF2型DNA和RNA解旋酶的特征核苷酸结合位点的一部分。

研究表明，序列SPXX或STXX经常出现在DNA结合位点上，也被一些蛋白激酶识别为底物。多肽的结构研究表明，这种四肽可以采用ST基序的氢键模式。

ST staple是蛋白质和多肽中常见的四或五氨基酸残基基序，其C端残基为丝氨酸或苏氨酸。它的特征是在丝氨酸或苏氨酸的羟基(在残基i + 3或i + 4)和残基i的主链羰基之间有一个单氢键。基序有两种类型，取决于基序是4个残基还是5个残基。大多数ST staple与alpha螺旋一起发生，通常与螺旋的轻微弯曲有关。有两个网站可用于寻找和检查蛋白质中的ST staple: Motivated proteins和PDBeMotif。

5个残基的ST staple。这个五肽含有一个C端苏氨酸加上前面四个残基的主链原子。氢原子加上一些末端主链原子被省略了。碳灰，氧红，氮蓝。氢键用灰色虚线表示。